Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trpv3Q8K424 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms