Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MyripQ8K3I4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MyripQ8K3I4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms