Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prpf39Q8K2Z2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms