Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X2

Rbm48, RNA-binding protein 48, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rbm48Q8K2X2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rbm48Q8K2X2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rbm48Q8K2X2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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