Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brd3Q8K2F0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Brd3Q8K2F0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms