Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Snrnp27Q8K194 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snrnp27Q8K194 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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