Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sh2d5Q8JZW5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms