Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LgsnQ8CIX8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms