Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TwnkQ8CIW5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms