Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI15

Sphk1, Sphingosine kinase 1, mousemouse

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sphk1Q8CI15 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sphk1Q8CI15 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sphk1Q8CI15 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sphk1Q8CI15 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sphk1Q8CI15 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Sphk1Q8CI15 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sphk1Q8CI15 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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