Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Upp2Q8CGR7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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