Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hpf1Q8CFE2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hpf1Q8CFE2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hpf1Q8CFE2 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hpf1Q8CFE2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hpf1Q8CFE2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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