Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ercc8Q8CFD5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ercc8Q8CFD5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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