Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pramef8Q8CE24 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pramef8Q8CE24 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Pramef8Q8CE24 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pramef8Q8CE24 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms