Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc63Q8CDV6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc63Q8CDV6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms