Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q8CD60 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8CD60 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8CD60 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8CD60 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms