Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp9Q8CAS9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms