Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ppfibp1Q8C8U0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms