Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc113Q8C5T8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc113Q8C5T8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms