Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sfrp1Q8C4U3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms