Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hdac7Q8C2B3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Hdac7Q8C2B3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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