Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Cpne1Q8C166 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cpne1Q8C166 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cpne1Q8C166 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Cpne1Q8C166 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cpne1Q8C166 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cpne1Q8C166 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cpne1Q8C166 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cpne1Q8C166 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cpne1Q8C166 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cpne1Q8C166 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cpne1Q8C166 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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