Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atg16l1Q8C0J2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg16l1Q8C0J2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms