Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm38195-201ENSMUST00000194247 1499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Gm37963-201ENSMUST00000195351 613 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trim35Q8C006 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms