Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Iffo1Q8BXL9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Iffo1Q8BXL9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Iffo1Q8BXL9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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