Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cldn17Q8BXA6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn17Q8BXA6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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