Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ube3dQ8BX13 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ube3dQ8BX13 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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