Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms