Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cops7bQ8BV13 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms