Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tyw3Q8BSA9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tyw3Q8BSA9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms