Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRU6

Slc18a2, Synaptic vesicular amine transporter, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a2Q8BRU6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Slc18a2Q8BRU6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Slc18a2Q8BRU6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Slc18a2Q8BRU6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Slc18a2Q8BRU6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Slc18a2Q8BRU6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Slc18a2Q8BRU6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc18a2Q8BRU6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms