Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf18Q8BM39 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms