Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smoc1Q8BLY1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms