Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpc2Q8BKV1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpc2Q8BKV1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms