Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rufy1Q8BIJ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rufy1Q8BIJ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms