Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Frmd4aQ8BIE6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms