Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clrn3Q8BHH8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Clrn3Q8BHH8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clrn3Q8BHH8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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