Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atg4bQ8BGE6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atg4bQ8BGE6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg4bQ8BGE6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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