Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrtm2Q8BGA3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrrtm2Q8BGA3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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