Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrrc27Q80YS5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lrrc27Q80YS5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Lrrc27Q80YS5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrrc27Q80YS5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lrrc27Q80YS5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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