Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lrfn4Q80XU8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrfn4Q80XU8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrfn4Q80XU8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Lrfn4Q80XU8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lrfn4Q80XU8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms