Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Ttc28Q80XJ3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ttc28Q80XJ3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc28Q80XJ3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms