Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nrde2Q80XC6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nrde2Q80XC6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms