Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pcsk9Q80W65 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms