Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pnma8aQ80VM8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pnma8aQ80VM8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms