Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG2

Plxna4, Plexin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 1,893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna4Q80UG2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna4Q80UG2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna4Q80UG2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna4Q80UG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Plxna4Q80UG2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms