Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp8Q80U87 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms