Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms