Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tnfsf18Q7TS55 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tnfsf18Q7TS55 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms