Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LnpkQ7TQ95 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LnpkQ7TQ95 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms